« Bybee S.M. & al. 2021 » : différence entre les versions
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'''Auteurs''' : Bybee S.M., Kalkman V.J., Erickson R.J., Frandsen P.B., Breinholt J.B., Suvorov A., Dijkstra K.D., Cordero-Rivera A., Skevington J.H., Abbott J.C., Sanchez Herrera M., Lemmon A.R., Moriarty Lemmon E. & Ware J.L. | |||
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'''Résumé''' (traduction libre)<br> | '''Résumé''' (traduction libre)<br> | ||
Les Libellules et les Demoiselles constituent un ordre d'insectes charismatique et de taille moyenne (~6300 espèces) avec un potentiel unique pour aborder les questions de recherche comparative. Leur taxonomie et de nombreux traits écologiques pour une grande partie des espèces existantes sont relativement bien compris. Cependant, jusqu'à présent, l'absence d'une phylogénie à grande échelle basée sur des données à haut débit et permettant de connecter les deux perspectives a empêché les questions d'évolution comparative de ces insectes. Ici, nous proposons une hypothèse de classification ordinale basée sur l'enrichissement hybride ancré en utilisant un total de 136 espèces représentant 46 des 48 familles ou ''incertae sedis'', et un total de 478 loci cibles. Nos analyses ont retrouvé la monophylie pour les trois sous-ordres : [[Anisoptera]], [[Anisozygoptera]] et [[Zygoptera]]. Bien que l'essentiel de la topologie ait été renforcée et ait montré les valeurs de soutien les plus élevées à ce jour, nos données génomiques n'ont pas permis de résoudre fortement certaines parties de la topologie. En outre, une approche d'échantillonnage par quatuor met en évidence les scénarios évolutifs potentiels qui ont pu façonner la phylogénie évolutive (par exemple, tri incomplet des lignées et introgression) de ce taxon. Enfin, à la lumière de notre reconstruction phylogénomique et des informations morphologiques et moléculaires précédentes, nous avons proposé une classification actualisée des odonates et défini cinq nouvelles familles ([[Amanipodagrionidae]] fam. nov, [[Mesagrionidae]] fam. nov., [[Mesopodagrionidae]] fam. nov., [[Priscagrionidae]] fam. nov., [[Protolestidae]] fam. nov.) et en rétablir deux autres ([[Rhipidolestidae]] stat. res., [[Tatocnemididae]] stat. res.). En outre, nous présentons les groupements taxonomiques problématiques pour examen dans des études futures afin d'améliorer notre hypothèse phylogénétique actuelle. | Les Libellules et les Demoiselles constituent un ordre d'insectes charismatique et de taille moyenne (~6300 espèces) avec un potentiel unique pour aborder les questions de recherche comparative. Leur taxonomie et de nombreux traits écologiques pour une grande partie des espèces existantes sont relativement bien compris. Cependant, jusqu'à présent, l'absence d'une phylogénie à grande échelle basée sur des données à haut débit et permettant de connecter les deux perspectives a empêché les questions d'évolution comparative de ces insectes. Ici, nous proposons une hypothèse de classification ordinale basée sur l'enrichissement hybride ancré en utilisant un total de 136 espèces représentant 46 des 48 familles ou ''incertae sedis'', et un total de 478 loci cibles. Nos analyses ont retrouvé la monophylie pour les trois sous-ordres : ''[[Anisoptera]], [[Anisozygoptera]]'' et ''[[Zygoptera]]''. Bien que l'essentiel de la topologie ait été renforcée et ait montré les valeurs de soutien les plus élevées à ce jour, nos données génomiques n'ont pas permis de résoudre fortement certaines parties de la topologie. En outre, une approche d'échantillonnage par quatuor met en évidence les scénarios évolutifs potentiels qui ont pu façonner la phylogénie évolutive (par exemple, tri incomplet des lignées et introgression) de ce taxon. Enfin, à la lumière de notre reconstruction phylogénomique et des informations morphologiques et moléculaires précédentes, nous avons proposé une classification actualisée des odonates et défini cinq nouvelles familles (''[[Amanipodagrionidae]]'' fam. nov, ''[[Mesagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Mesopodagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Priscagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Protolestidae]]'' fam. nov.) et en rétablir deux autres (''[[Rhipidolestidae]]'' stat. res., ''[[Tatocnemididae]]'' stat. res.). En outre, nous présentons les groupements taxonomiques problématiques pour examen dans des études futures afin d'améliorer notre hypothèse phylogénétique actuelle. | ||
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'''Abstract'''<br> | '''Abstract'''<br> | ||
Dragonflies and damselflies are a charismatic, medium-sized insect order (~6300 species) with a unique po- tential to approach comparative research questions. Their taxonomy and many ecological traits for a large fraction of extant species are relatively well understood. However, until now, the lack of a large-scale phylogeny based on high throughput data with the potential to connect both perspectives has precluded comparative evolutionary questions for these insects. Here, we provide an ordinal hypothesis of classification based on anchored hybrid enrichment using a total of 136 species representing 46 of the 48 families or incertae sedis, and a total of 478 target loci. Our analyses recovered the monophyly for all three suborders: [[Anisoptera]], [[Anisozygoptera]] and [[Zygoptera]]. Although the backbone of the topology was reinforced and showed the highest support values to date, our genomic data was unable to stronglyresolve portions of the topology. In addition, a quartet sampling approach highlights the potential evolutionary scenarios that may have shaped evolutionary phylogeny (e.g., incomplete lineage sorting and introgression) of this taxon. Finally, in light of our phylogenomic | Dragonflies and damselflies are a charismatic, medium-sized insect order (~6300 species) with a unique po- tential to approach comparative research questions. Their taxonomy and many ecological traits for a large fraction of extant species are relatively well understood. However, until now, the lack of a large-scale phylogeny based on high throughput data with the potential to connect both perspectives has precluded comparative evolutionary questions for these insects. Here, we provide an ordinal hypothesis of classification based on anchored hybrid enrichment using a total of 136 species representing 46 of the 48 families or incertae sedis, and a total of 478 target loci. Our analyses recovered the monophyly for all three suborders: ''[[Anisoptera]], [[Anisozygoptera]]'' and ''[[Zygoptera]]''. Although the backbone of the topology was reinforced and showed the highest support values to date, our genomic data was unable to stronglyresolve portions of the topology. In addition, a quartet sampling approach highlights the potential evolutionary scenarios that may have shaped evolutionary phylogeny (e.g., incomplete lineage sorting and introgression) of this taxon. Finally, in light of our phylogenomic reconstruction and previous morphological and molecular information we proposed an updated odonate classification and define five new families (''[[Amanipodagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Mesagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Mesopodagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Priscagrionidae]]'' fam. nov., ''[[Protolestidae]]'' fam. nov.) and reinstate another two (''[[Rhipidolestidae]]'' stat. res., ''[[Tatocnemididae]]'' stat. res.). Additionally, we feature the problematic taxonomic groupings for examination in future studies to improve our current phylogenetic hypothesis. | ||
Les résultats de | == Commentaires sur ce site (''com. pers.'') == | ||
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Les résultats de Bybee & al. (2021) sont parfaitement conformes à mes travaux antérieurs, mais non "officiels" du point de vue nomenclatural (Deliry 2014, 2018) à fort peu de détails près. Ceux-ci viennent donc conforter mes vues en ce qui concerne en particulier les [[Zygoptères]] et n'apportent finalement aucune nouveauté, sinon un renfort d'arguments multiples, la réflexion ayant déjà été menée (Deliry 2014) et confirmée (Deliry 2018). Mes travaux ne sont pas cités.<br> | |||
Voir [[Classification des Odonates]] | Voir [[Classification des Odonates]] | ||
* ''[[Amanipodagrionidae]]'' Dijkstra & Ware, 2021 = ''[[Amanipodagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | * ''[[Amanipodagrionidae]]'' Dijkstra & Ware, 2021 = ''[[Amanipodagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | ||
* ''[[Mesagrionidae]]'' Kalkman & Sanchez-Herrera, 2021 = ''recte'' : inclusion dans les ''[[Argiolestidae]]'' Fraser, 1957 selon Deliry (2014) | * ''[[Mesagrionidae]]'' Kalkman & Sanchez-Herrera, 2021 = ''recte'' : inclusion dans les ''[[Argiolestidae]]'' Fraser, 1957 selon Deliry (2014) | ||
* ''[[Mesopodagrionidae]]'' Kalkman & Abbott, 2021 - ''[[Mesopodagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | * ''[[Mesopodagrionidae]]'' Kalkman & Abbott, 2021 - ''[[Mesopodagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | ||
* ''[[Priscagrionidae]]'' Kalkman & Bybee, 2021 = ''recte'' : ''[[Sinocnemididae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | * ''[[Priscagrionidae]]'' Kalkman & Bybee, 2021 = ''recte'' : ''[[Sinocnemididae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) > ''[[Sinocnemididae]]'' Deliry, 2021 (''nomen novum'') | ||
* ''[[Protolestidae]]'' Dijkstra & Bybee, 2021 = ''[[Protolestidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | * ''[[Protolestidae]]'' Dijkstra & Bybee, 2021 = ''[[Protolestidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) | ||
* ''[[Rhipidolestidae]]'' Silsby & Parr, 2001 [''recte hic''] (cités ''[[Rhipidolestidae]]'' Silsby, 2001 par Bybee & al. (2021) = ''recte'' : ''[[Thaumatoneuridae]]'' Tillyard & Fraser, 1938 d'après Deliry (2014) | * ''[[Rhipidolestidae]]'' Silsby & Parr, 2001 [''recte [[hic]]''] (cités ''[[Rhipidolestidae]]'' Silsby, 2001 par Bybee & al. (2021) = ''recte'' : ''[[Thaumatoneuridae]]'' Tillyard & Fraser, 1938 d'après Deliry (2014)) | ||
* ''[[Tatocnemididae]]'' Rácenis, 1959 = ''[[Tatocnemididae]]'' Rácenis, 1959 famille déjà rétablie par Deliry (2014) | * ''[[Tatocnemididae]]'' Rácenis, 1959 = ''[[Tatocnemididae]]'' Rácenis, 1959 famille déjà rétablie par Deliry (2014) | ||
Les éléments proposés par Bybee & al. (2021) se concentrent sur le cas des ''[[Zygoptera]]'' et un réarrangement de leurs familles. J'ai avancé la réflexion plus loin et ajouté les familles suivantes (Deliry 2014, 2018) : ''[[Chorismagrionidae]]'' Tillyard & Fraser, 1938, ''[[Megalestidae]]'' Tillyard & Fraser, 1939, ''[[Nubiolestidae]]'' Bechly, 1996, ''[[Indolestidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.), ''[[Dimeragrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.), ''[[Hetaerinidae]]'' Tillyard & Fraser, 1939. Nous avons en parallèle remonté les sous-familles des ''[[Coenagrionidae s.l.]]'' au niveau de famille, pour bon ordre et équilibre du nombre des taxons par famille ainsi que proposé pour la cohérence de l'ensemble les familles suivantes : ''[[Antiagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.), ''[[Ceriagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.) et ''[[Austrocoenagrionidae]]'' Deliry, [2014] (en prép.). Les autres familles sont les ''[[Pseudostigmatidae]]'' Kirby, 1890 (mise en évidence en 2021, ''[[hic]]''), ''[[Protoneuridae]]'' Jacobson & Bianchi, 1905, ''[[Argiidae]]'' Tillyard, 1917, ''[[Coenagrionidae]]'' Kirby, 1890 [sens strict], ''[[Agriocnemidae]]'' Fraser, 1957 et ''[[Ischnuraidae]]'' Fraser, 1957 (d'abord selon l'orthographe corrigée proposée par Fet & Bechly 2000 ; [[Ischnuridae|Voir les détails de cette famille]]). Nous avons fait de même ([[hic]] 2021) pour les ''[[Platycnemididae s.l.]]''.<br> | |||
Là où Bybee & al. (2021) prévoit trois sous-ordres (''[[Zygoptera]], [[Anisozygoptera]]'' et ''[[Anisoptera]]''), je n'en ai retenu deux seulement (Deliry 2014, 2018) (''[[Zygoptera]]'' et ''[[Epiprocta]]'', ce dernier avec deux infra-ordres ''[[Epiophlebioptera]]'' et ''[[Anisoptera]]''). Bybee & al. (2021) n'ont pas poussé leur réflexion sur les ''[[Anisoptera]]'' où je propose un refonte détaillée des familles (voir détails ici : ''[[Anisoptera]]'') notamment des ''[[Aeshnidae s.l.]], [[Gomphidae s.l.]]'' et ''[[Libellulidae s.l.]]''. J'ai par ailleurs revu des ensembles polyphylétiques maintenus jusqu'alors artificiellement comme les ''[[Synthemistidae s.l.]]'' et les ''[[Corduliidae s.l.]]''. | |||
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* 2022 - '''Voir aussi''' : ''[[Anisozygoptera]]''. | |||
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Dernière version du 25 décembre 2024 à 20:41
Deliry C. [2025] – Bybee S.M. & al. 2021 - In : Odonates du Monde (Histoires Naturelles) (2004-[2025]) – Version 48524 du 25.12.2024. – odonates.net
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Bybee S.M. & al. 2021 - Phylogeny and classification of Odonata using targeted genomics. - Molecular Phylogenetics and Evolution, 18 février 2021.
Auteurs : Bybee S.M., Kalkman V.J., Erickson R.J., Frandsen P.B., Breinholt J.B., Suvorov A., Dijkstra K.D., Cordero-Rivera A., Skevington J.H., Abbott J.C., Sanchez Herrera M., Lemmon A.R., Moriarty Lemmon E. & Ware J.L.
Résumé (traduction libre)
Les Libellules et les Demoiselles constituent un ordre d'insectes charismatique et de taille moyenne (~6300 espèces) avec un potentiel unique pour aborder les questions de recherche comparative. Leur taxonomie et de nombreux traits écologiques pour une grande partie des espèces existantes sont relativement bien compris. Cependant, jusqu'à présent, l'absence d'une phylogénie à grande échelle basée sur des données à haut débit et permettant de connecter les deux perspectives a empêché les questions d'évolution comparative de ces insectes. Ici, nous proposons une hypothèse de classification ordinale basée sur l'enrichissement hybride ancré en utilisant un total de 136 espèces représentant 46 des 48 familles ou incertae sedis, et un total de 478 loci cibles. Nos analyses ont retrouvé la monophylie pour les trois sous-ordres : Anisoptera, Anisozygoptera et Zygoptera. Bien que l'essentiel de la topologie ait été renforcée et ait montré les valeurs de soutien les plus élevées à ce jour, nos données génomiques n'ont pas permis de résoudre fortement certaines parties de la topologie. En outre, une approche d'échantillonnage par quatuor met en évidence les scénarios évolutifs potentiels qui ont pu façonner la phylogénie évolutive (par exemple, tri incomplet des lignées et introgression) de ce taxon. Enfin, à la lumière de notre reconstruction phylogénomique et des informations morphologiques et moléculaires précédentes, nous avons proposé une classification actualisée des odonates et défini cinq nouvelles familles (Amanipodagrionidae fam. nov, Mesagrionidae fam. nov., Mesopodagrionidae fam. nov., Priscagrionidae fam. nov., Protolestidae fam. nov.) et en rétablir deux autres (Rhipidolestidae stat. res., Tatocnemididae stat. res.). En outre, nous présentons les groupements taxonomiques problématiques pour examen dans des études futures afin d'améliorer notre hypothèse phylogénétique actuelle.
Abstract
Dragonflies and damselflies are a charismatic, medium-sized insect order (~6300 species) with a unique po- tential to approach comparative research questions. Their taxonomy and many ecological traits for a large fraction of extant species are relatively well understood. However, until now, the lack of a large-scale phylogeny based on high throughput data with the potential to connect both perspectives has precluded comparative evolutionary questions for these insects. Here, we provide an ordinal hypothesis of classification based on anchored hybrid enrichment using a total of 136 species representing 46 of the 48 families or incertae sedis, and a total of 478 target loci. Our analyses recovered the monophyly for all three suborders: Anisoptera, Anisozygoptera and Zygoptera. Although the backbone of the topology was reinforced and showed the highest support values to date, our genomic data was unable to stronglyresolve portions of the topology. In addition, a quartet sampling approach highlights the potential evolutionary scenarios that may have shaped evolutionary phylogeny (e.g., incomplete lineage sorting and introgression) of this taxon. Finally, in light of our phylogenomic reconstruction and previous morphological and molecular information we proposed an updated odonate classification and define five new families (Amanipodagrionidae fam. nov., Mesagrionidae fam. nov., Mesopodagrionidae fam. nov., Priscagrionidae fam. nov., Protolestidae fam. nov.) and reinstate another two (Rhipidolestidae stat. res., Tatocnemididae stat. res.). Additionally, we feature the problematic taxonomic groupings for examination in future studies to improve our current phylogenetic hypothesis.
Commentaires sur ce site (com. pers.)
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Les résultats de Bybee & al. (2021) sont parfaitement conformes à mes travaux antérieurs, mais non "officiels" du point de vue nomenclatural (Deliry 2014, 2018) à fort peu de détails près. Ceux-ci viennent donc conforter mes vues en ce qui concerne en particulier les Zygoptères et n'apportent finalement aucune nouveauté, sinon un renfort d'arguments multiples, la réflexion ayant déjà été menée (Deliry 2014) et confirmée (Deliry 2018). Mes travaux ne sont pas cités.
Les éléments proposés par Bybee & al. (2021) se concentrent sur le cas des Zygoptera et un réarrangement de leurs familles. J'ai avancé la réflexion plus loin et ajouté les familles suivantes (Deliry 2014, 2018) : Chorismagrionidae Tillyard & Fraser, 1938, Megalestidae Tillyard & Fraser, 1939, Nubiolestidae Bechly, 1996, Indolestidae Deliry, [2014] (en prép.), Dimeragrionidae Deliry, [2014] (en prép.), Hetaerinidae Tillyard & Fraser, 1939. Nous avons en parallèle remonté les sous-familles des Coenagrionidae s.l. au niveau de famille, pour bon ordre et équilibre du nombre des taxons par famille ainsi que proposé pour la cohérence de l'ensemble les familles suivantes : Antiagrionidae Deliry, [2014] (en prép.), Ceriagrionidae Deliry, [2014] (en prép.) et Austrocoenagrionidae Deliry, [2014] (en prép.). Les autres familles sont les Pseudostigmatidae Kirby, 1890 (mise en évidence en 2021, hic), Protoneuridae Jacobson & Bianchi, 1905, Argiidae Tillyard, 1917, Coenagrionidae Kirby, 1890 [sens strict], Agriocnemidae Fraser, 1957 et Ischnuraidae Fraser, 1957 (d'abord selon l'orthographe corrigée proposée par Fet & Bechly 2000 ; Voir les détails de cette famille). Nous avons fait de même (hic 2021) pour les Platycnemididae s.l.. |
- 2022 - Voir aussi : Anisozygoptera.
Deliry C. 2014 - Classification phylogénétique des Libellules. - Histoires Naturelles n°34. - A la demande
Deliry C. 2018 - Essai de classification phylogénétique des Odonates. - Histoires Naturelles n°56. - PDF
Deliry C. [2021] - Odonates du Monde. - Histoires Naturelles (2004-2025). - odonates.net
Fet V. & Bechly G. 2000 - Case 3120. Ischnurainae Fraser, 1957 (Insecta : Odonata) : proposed conservation as the correct spelling of Ischnurinae to remove homonymy with Ischnuridae Simon, 1879 (Arachnida : Scorpiones). - Bull. of Zool. Nomenclature, 57 (1) : 26-28.
